《钢之炼金术师》讲述爱德华与阿尔冯斯兄弟因思念亡母，触犯炼金术最大禁忌——人体炼成术，试图复活母亲，却遭遇巨大灾难。阿尔冯斯失去整个身体，灵魂被封印在铠甲中；爱德华则以右臂和左脚为代价，勉强保住弟弟。为恢复原状，兄弟俩踏上寻找贤者之石的旅程。

旅途中，他们结识众多伙伴，也直面人造人、军方阴谋与国土炼成阵的真相。贤者之石以活人生命炼成，背后牵扯出国家层级的黑暗秘密。爱德华逐渐明白，炼金术并非万能，等价交换原则无法衡量生命与亲情。最终，兄弟俩在牺牲与抉择中，选择用各自的方式找回失去之物，完成成长与救赎。