铃木财团巨资营建的铃木塔盛大开幕，柯南与少年侦探团受邀参观。突然，一名游客被远处射来的子弹狙击身亡，柯南迅速锁定凶手并展开追击，然而凶手胆大包天，在逃亡中再度开枪。

FBI探员朱蒂与卡迈尔介入调查，发现凶手竟是前海豹突击队狙击手。案件与两年前波士顿的连环狙击案高度相似，赤井秀一也以冲矢昴身份暗中协助。柯南通过弹道分析，推断狙击点位于异次元般的超远距离。

随着调查深入，凶手的目标指向铃木塔的隐藏秘密。柯南与赤井秀一隔空配合，在千钧一发之际阻止了更大惨剧。最终真相浮出水面，一场围绕军事机密与复仇的阴谋被彻底揭开。