《新世纪福音战士剧场版：Air/真心为你》是1997年上映的EVA旧剧场版，由庵野秀明执导，分为“Air”与“真心为你”两部分，作为TV版第25、26话的另一种结局，重新演绎了人类补完计划的高潮。

故事紧接TV版尾声。SEELE发动全面进攻，NERV总部陷入战火。葛城美里在危急时刻完成加持良治的遗愿，将“第二次浩劫”的真相与人类补完计划的关键信息传递给真嗣。绫波丽在碇元度的引导下来到中央教条红色水池边，最终选择背叛元度，与莉莉丝融合，将命运之矛交予真嗣，把选择权交给了他。

真嗣在极度痛苦中目睹明日香驾驶二号机被量产机残忍撕裂，精神几近崩溃。当莉莉丝展开反AT力场，所有人类灵魂融合为一，世界化为橙红色的海洋。在补完的虚无中，真嗣最终选择拒绝这种虚假的安宁，保留了人与人之间的隔阂与痛苦，也保留了作为个体存在的可能。结尾，真嗣与明日香躺在猩红的海滩上，明日香一句“真恶心”为这部悲壮终章画上句号。